Construite selon le modèle d'un château bordelais par les frères Greenlees entre 1881 et 1883, la distillerie Bunnahabhain appartient depuis 1887 au groupe Highlands Distillers après avoir opéré sous le nom de Islay Distillery. Agrandie en 1963, elle fut mise en sommeil provisoirement en 1983. Elle eut plus de chance que la distillerie Port Ellen fermée définitivement la même année. Après quelques mois de fermeture pour travaux, la distillerie a été remise en activité à l'automne 2001. La distillerie a été vendue en mai 2003 à Burn Stewart Distillers par Highlands Distillers Co. Burn Stewart a été racheté par une société basée à Trinidad, CL Financial Ltd, qui possède entre autres Angostura. Les autres distilleries appartenant à Burn Stewart sont Tobermory et Deanston 95% de la production est destinée aux assemblages, entre autres Black Bottle et The Famous Grouse.